Mikrobiološke pretrage
Popis i postupci davanja uzoraka
Stolica (feces)
Uzorak stolice za bakteriološku pretragu
- Uzorak stolice uzeti na početku bolesti,
- Uzorak stolice ne smije biti kontaminiran mokraćom ili sadržavati dezinficijense i sapune
- Potrebna su 2-3 ml uzorka tekuće stolice ili 1-2 g uzorka čvrste stolice (veličina lješnjaka) staviti u posudicu
- Uzorak stolice treba dostaviti u laboratorij najkasnije 2 sata od uzimanja
- Ukoliko to nije moguće, uzorak se može pohraniti na +4°C najduže 24 sata do dostave u laboratorij
- Bris rektuma uzeti jedino kada nije moguće dobiti uzorak stolice (djeca, teški bolesnici), a daljnji postupak je kao s uzorkom stolice
- Rezultati bakteriološke pretrage uzorka stolice ili bris rektuma dostupni su za 2-5 dana
Uzorak stolice za virološku pretragu (Noro, Adeno, Rota)
- Uzorak stolice uzeti u prva 3 dana od početka simptoma (najbolje 2 uzorka stolice unutar 24 sata)
- Potrebna su 2-3 ml uzorka tekuće stolice ili 1-2 g uzorka čvrste stolice (veličina lješnjaka) staviti u posudicu
- Uzorak stolice treba odmah dostaviti u laboratorij, a ako to nije moguće uzorak može biti pohranjen na +4°C, dostavlja se u putnom hladnjaku
- Rezultati pretrage uzoraka stolice dostupni su za 1-2 dana
Uzorak stolice za parazitološku pretragu
- Potrebna su 2-3 ml uzorka tekuće stolice ili 1-2 g uzorka čvrste stolice (veličina lješnjaka)
- Uzorak stolice treba odmah dostaviti u laboratorij ili ga pohraniti na +4°C tijekom 24-48 sati
- Za dokaz kriptosporidioze rutinski se obrađuju samo uzorci krvavo-sluzave i tekuće stolice
- Rezultati parazitološke pretrage uzorka stolice dostupni su za 1-3 dana
Uzorak stolice za mikološku pretragu
- Potrebna su 2-3 ml uzorka tekuće stolice ili 1-2 g uzorka čvrste stolice (veličina lješnjaka)
- Uzorak stolice treba odmah dostaviti u laboratorij ili ga pohraniti na +4°C tijekom 24-48 sati
- Uzorak stolice treba uzeti 7-10 dana nakon završene antibiotske terapije
- Rezultati mikološke pretrage uzorka stolice dostupni su za 3-5 dana
Perianalni otisak
Perianalni otisak za dokaz jaja parazita Enterobius vermicularis
- Predmetno stakalce s ljepljivom trakom može se dobiti u prijemnoj ambulantu
- Prije uzimanja perianalnog otiska, 2 do 3 dana ne treba prati vodom i sapunom područje oko anusa, brisati samo toaletnim papirom
- Perianalni otisak uzeti ujutro nakon ustajanja
- Ljepljivu traku treba odlijepiti sa stakalca, raširiti gluteuse i nalijepiti traku preko perianalnih nabora uz blago pritiskanje
- Traku zatim skinuti i nalijepiti ponovo preko stakalca
- Predmetno stakalce staviti u ambalažu i dostaviti u laboratorij tijekom 24 sata
- Rezultat pretrage dostupan je za 1 dan
Bris ždrijela i tonzila
Bris ždrijela za bakteriološku pretragu
- Uzorak treba dostaviti u laboratorij unutar 2 sata od uzimanja
- Ukoliko to nije moguće bris treba uložiti u hranjivu pologu, čuvati na sobnoj temperaturi (22-25°C) i dostaviti u laboratorij unutar 24 sata
- Rezultat bakteriološke pretrage dostupan je za 1-3 dana
Bris nosa za bakteriološku pretragu
- Uzorak treba dostaviti u laboratorij unutar 2 sata od uzimanja
- Ukoliko to nije moguće bris treba uložiti u hranjivu podlogu, čuvati na sobnoj temperaturi (22-25°C) i dostaviti u laboratorij unutar 24 sata
- Uzorak se uzima za otkrivanje stafilokoknog ili streptokoknog kliconoštva ili za ispitivanje lezija u nosu
Bris usne šupljine za mikološku pretragu
- Uzorak treba dostaviti u laboratorij unutar 24 sata
- Rezultati mikološke pretrage dostupni su za 3-5 dana
Bris nazofarinksa
Bris nazofarinksa za bakteriološku pretragu:
- Uzorak treba dostaviti u laboratorij unutar 2 sata od uzimanja
- U slučaju da to nije moguće bris treba uložiti u hranjivu pologu, čuvati na sobnoj temperaturi (22-25°C) i dostaviti u laboratorij unutar 24 sata
- Rezultati bakteriološke pretrage dostupan je za 1-3 dana
Bris nazofarinksa za mikološku pretragu:
- Uzorak treba dostaviti u laboratorij unutar 2 sata od uzimanja
- U slučaju da to nije moguće bris treba uložiti u hranjivu pologu, čuvati na sobnoj temperaturi (22-25°C) i dostaviti u laboratorij unutar 24 sata
- Rezultati bakteriološke pretrage dostupan je za 3-5 dana
Bris nazofarinksa PCR Sars-Cov-2 i PCR B. pertussis/parapertussis
- Pripremiti sterilni bris s dugim, tankim i elastičnim štapićem te epruvetom.
- Bris uroniti u sterilnu fiziološku otopinu.
- Glavu držati ravno i lagano podići vrh nosa kako bi se izravnao nosni hodnik.
- Umetnite bris u nosnicu, pazeći da ne dodirnete kožu, prateći nosni hodnik do stražnje stijenke nazofarinksa. Lagano rotirajte bris najmanje 5 sekundi kako bi apsorbirao sekret.
- Ponoviti postupak u drugoj nosnici.
- Bris dostaviti u laboratorij unutar 2 sata. Ako to nije moguće, pohraniti ga na +4 °C do najviše 24 sata prije dostave.
- Rezultati pretrage dostupni su za 1 dan
Bris nazofarinksa Sars-Cov-2/detekcija antigena:
- Umetnite bris u nosnicu, pazeći da ne dodirnete kožu, prateći nosni hodnik do stražnje stijenke nazofarinksa. Lagano rotirajte bris najmanje 5 sekundi kako bi apsorbirao sekret.
- Rezultati pretrage dostupni su za 1 sat
Iskašljaj (sputum)
Uzorak sputuma za bakteriološku i mikološku pretragu
- Jutarnji sputum je najpogodniji uzorak
- Prije uzimanja sputuma bolesnika treba uputiti o ispravnom postupku davanja uzorka
- Bolesnik treba oprati zube četkicom bez zubne paste i isprati usta vodom da bi se smanjio broj popratnih bakterija, dijelova hrane ili ostataka lijekova
- Važno je upozoriti bolesnika da nazofaringealni sekret ili slina nisu sputum
- Bolesnik se treba duboko nakašljati i izbaciti sputum u sterilnu posudu (> 2 mL)
- Uzorak sputuma treba dostaviti u laboratorij u roku od 2 sata, najkasnije 24 sata od uzimanja uz pohranu na +4°C
- Rezultati bakteriološke pretrage dostupni su za 2-5 dana
- Rezultati mikološke pretrage dostupni su za 3-7 dana
Uzorak aspirata bronha i bronhoalveolarnog lavata (BAL)
Uzorak aspirata bronha i bronhoalveolarnog lavata za bakterioošku i mikološku pretragu
- Treba poslati što veću količinu uzorka
- Uzorak treba odmah po uzimanju dostaviti u laboratorij ili ga treba pohraniti do dostave na +4°C
- Rezultat bakteriološke pretrage dostupan je za 2-5 dana, a za mikološku pretragu 3-7 dana
Uzorci pleuralne, peritonejske i zglobne tekućine
Uzorci pleuralne, peritonejske i zglobne tekućine za bakteriološku i mikološku pretragu
- Treba dostaviti u laboratorij u roku od 2 sata, najkasnije 24 sata od uzimanja uz pohranu na +4°C
- Rezultati bakteriološke pretrage dostupan je za 2-5 dana, a za mikološku pretragu dostupni su za 3-7 dana
Bris spojnice oka
Bris spojnice oka za bakteriološku i mikološku pretragu
- Prije uzimanja brisa ne smije se umivati, mazati kremama i šminkati
- Bris treba dostaviti u laboratorij u roku od 2 sata, najkasnije 24 sata od uzimanja uz pohranu na +4°C
- Rezultati bakteriološke pretrage dostupni su za 2-5 dana
- Rezultati mikološke pretrage dostupni su za 3-7 dana
- Za pretragu C. trahomatis PCR potrebno je dostaviti bris u adekvatnoj transportnoj podlozi
- Rezultati pretrage na Chlamydia trachomatis PCR-metodom dostupni su za 2-5 dana
Uzorci iz rane, ulkusa, apscesa i dekubitusa
Uzorci iz rane, ulkusa, apscesa i dekubitusa za bakteriološku i mikološku pretragu
- Ranu treba prethodno očistiti sterilnom fiziološkom otopinom, uzeti duboki bris rane i dostaviti odmah u laboratorij
- Ukoliko to nije moguće uzorak treba pohraniti u transportnu podlogu na sobnu temperaturu i dostaviti u laboratorij u roku 24 sata
- Rezultati bakteriološke pretrage dostupni su za 2-5 dana
- Rezultati mikološke pretrage dostupni su za 3-7 dana
Bioptički uzorak tkiva
Bioptički uzorak tkiva za bakteriološku i mikološku pretragu
- Bioptat treba staviti u sterilnu fiziološku otopinu i odmah dostaviti u laboratorij
- Rezultat bakteriološke pretrage dostupni su za 2-5 dana
- Rezultat mikološke pretrage dostupni su za 3-7 dana
Uzorci za serološke pretrage
Uzorak seruma ili krvi
- U laboratorij može biti dostavljen uzorak krvi ili seruma, krv se uzima u aseptičkim uvjetima, 5-10 mL pune krvi u epruvetu bez antikoagulansa, puna krv se može dostaviti u roku 24 sata, a serum u dobro zatvorenim epruvetama u zaštičenim nepropusnim posudama
Uzorak cerebrospinalnog likvora
- Uzorak likvora može biti korišten i za serološke pretrage (TPHA), mora biti dostavljen i istovremeno uzeti serum
Krv za hemokulturu
Uzorak krvi (hemokultura) za bakteriološku i mikološku pretragu
- Prije venepunkcije kožu dezinficirati 70% alkoholom, nakon toga mjesto više ne palpirati. Istovremeno uzeti set (bočica za aerobnu i za anaerobni uzgoj su 1 set). Uzeti 2-3 seta u 24 sata, u akutnoj sepsi uzeti 2 seta unutar 10 minuta, prije antimikrobne terapije. Za odrasle se uzima 3-10 mL krvi, za djecu 1-3 mL krvi po bočici. Kod sumnje na kateter sepsu uzeti uzorak krvi iz periferije i CVK, naznačiti vrijeme uzimanja uzorka. Hemokulture odmah dostaviti u laboratorij, ako to nije moguće bočice trebaju biti pohranjene na sobnoj temperaturi najduže 24 sata do dostave.
- Negativan bakteriološki nalaz dostupan je za 5 dana, pozitivni nalazi se javljaju telefonom na odjel
- Rezultat mikološke pretrage dostupan je za 10 dana
Cerebrospinalni likvor
Uzorak likvora za bakteriološku i mikološku pretragu
- Uzorak likvora treba uzeti u bolničkoj ustanovi
- Uzorak likvora treba dostaviti u sterilnoj posudici u roku od 2 sata
- Pri sumnji na gnojni meningoencefalitis treba uzeti i uzorke krvi za hemokulturu
- Dijagnostika gnojnog meningitisa uzrokovanog drugim bakterijskim vrstama traje 2-3 dana
- Rezultat bakteriološke pretrage dostupan je za 2-5 dana
- Kultivacija gljivičnih uzročnika meningoencefalitisa traje od 3-7 dana (ovisno o vrsti očekivanog gljivičnog uzročnika i do 28 dana)
Mokraća
Uzorak mokraće za bakteriološku i mikološku pretragu
- Uzorak mokraće treba dostaviti u laboratorij u roku od dva sata
- Ukoliko to nije moguće uzorak treba pohraniti na +4°C i dostaviti u laboratorij najkasnije unutar 24 sata od uzimanja uzorka
- Postupak uzimanja uzorka mokraće za dokaz infekcije klamidijama isti je kao i za standardnu bakteriološku i mikološku pretragu mokraće, osim što je potrebno uzeti prvi mlaz prve jutarnje mokraće
- Rezultat bakteriološke pretrage dostupan je za 2-5 dana
- Rezultat mikološke pretrage dostupan je za 3-7 dana
- Rezultati izolacije i identifikacije mikoplazma i ureaplazma PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na Chlamydia trachomatis PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na T. vaginalis (trihomonoza) PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na N. gonorrhoeae PCR-metodom dostupni su za 7 dana
Bris cerviksa, vagine i uretre, ejakulat – eksprimat
Uzorci spolno-mokraćnog sustava ŽENA za bakteriološku, mikološku i parazitološku pretragu
- Bris (cerviksa, vagine i uretre) iz spolno-mokraćnog sustava žena uzima ginekolog i pohranjuje u transportnu podlogu ovisno o vrsti pretrage (bakteriološki i mikološki), a ostale pretrage koje se rade PCR-metodom u stanični medij
- Uzorke za bakteriološku i mikološku pretragu treba dostaviti u laboratorij u roku od 2 sata ili ako to nije moguće uzorak treba pohraniti u transportnu podlogu na sobnu temperaturu i dostaviti u laboratorij u roku 24 sata
- Uzorci ne smiju biti pohranjeni na sobnoj temperaturi ili na temperaturi hladnjaka (+4°C)
- Rezultat bakteriološke pretrage dostupan je za 2-5 dana
- Rezultat mikološke pretrage dostupan je za 2-5 dana
- Rezultati izolacije i identifikacije mikoplazma i ureaplazma PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na Chlamydia trachomatis PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na T. vaginalis PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na N. gonorrhoeae PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultat pretraga na HPV PCR-metodom dostupan je za 7 dana
Uzorci spolno-mokraćnog sustava MUŠKARACA za bakteriološku, mikološku i parazitološku pretragu
- Prije uzimanja brisa uretre i/ili ejakulata ne smije se mokriti barem 2 sati
- Uzorkovanje brisa uretre kod muškaraca obavlja stručno osoblje Službe za mikrobiologiju ili urolog u specijalističkoj ordinaciji
- Bris uretre i ejakulata za bakteriološku pretragu treba pohraniti u transportnu podlogu i dostaviti u laboratorij u roku od 24 sata, a za pretrage koje se rade PCR-metodom u stanični medij
- Rezultat bakteriološke pretrage dostupan je za 2-5 dana
- Rezultat mikološke pretrage dostupan je za 2-5 dana
- Rezultati izolacije i identifikacije mikoplazma i ureaplazma PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na Chlamydia trachomatis PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na T. vaginalis PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultati pretrage na N. gonorrhoeae PCR-metodom dostupni su za 7 dana
- Rezultat pretraga na HPV PCR-metodom dostupan je za 7 dana
Strugotina (dermatofiti)
- Najmanje 7 dana prije uzimanja strugotine kože, vlastišta ili noktiju potrebno je prekinuti primjenu bio kakvih antimikotičkih pripravaka
- Prije uzimanja uzorka oboljelo mjesto ne mazati nikakvim kremama
- Prije uzimanja strugotine noktiju potrebno je odstraniti lak s noktiju i podrezati koliko je moguće nokte škaricama
- uzorak uzima dermatolog u svojoj ordinaciji
- kožu/nokte treba očistiti 70% alkoholom, , strugati sa aktivnog, perifernog ruba lezije do u zdravo tkivo
- Negativan nalaz kulture strugotina gotov je nakon 3-4 tjedna kultivacije, za pozitivne nalaze potrebno je dodatno 1-2 tjedna obrade
Uzorci za mikobakteriološku pretragu
Tuberkuloza može zahvatiti svaki organ te se različiti uzorci mogu poslati na bakteriološku pretragu na tuberkulozu. Uzorci se uzimaju u posudice sa zatvaranjem na navoj.
Na posudici mora biti napisano ime i prezime pacijenta. Svaki uzorak mora biti popraćen uputnicom, koja po mogućnosti treba biti odvojena u plastičnoj vrećici
Iskašljaj (sputum)
- Za dokaz tuberkuloze preporučuje se uzimanje najmanje tri uzorka iskašljaja (prvi jutarnji iskašljaj u sterilnoj posudici) tijekom tri uzastopna dana.
- Posudica mora biti dostavljena u plastičnoj vrećici. Nikako ne skupljati više uzoraka u jednoj posudici
Mokraća
- Za dokaz tuberkuloze potrebno je uzeti prvi jutarnji urin, više uzoraka (5-6), treba ih držati u hladnjaku, dostaviti ih nakon uzimanja zadnjeg urina sve zajedno
Krv
- Za dokaz tuberkuloze treba uzeti 5-10 ml krvi u sterilnu epruvetu s čepom na navoj i dodati heparin (0,2 mg/ml) ili 1,5 ml 0,35% otopine natrijevog polietanol sulfata (SPS) na 8,5 m krvi da se spriječi grušanje krvi
Ostali uzorci
- Bronhoskopski uzorci (aspirat bronha, aspirat traheje i BAL)
- Punktati (pleuralni, perikardijalni, peritonealni i dr…)
- Želučani lavat - uzima se kod djece tijekom tri uzastopna dana, izuzetno kod djece koja ne mogu dati iskašljaj
- Bris (larinksa, ždrijela, rana, fistula i dr…)
- Biopsija tkiva
Rezultati pretrage
- Rezultat mikroskopske pretrage za sve uzorke (osim urina koji se ne mikroskopira) dostupan je za 2-3 radna dana
- Negativan rezultat kultivacija Mycobacterium tuberculosis dostupan je za 6 tjedana, pozitvni nalazi se javljaju na odjel/obiteljsku medicinu
- NZZJZ IŽ s odjelom za tuberkulozu spada u drugu razinu mikrobiološke dijagnostike tuberkuloze, te se ispitivanje osjetljivosti Mycobacterium tuberculosis na antituberkulostatike šalje u NRL, Nacionalni referentni laboratorij za mikobakterije pri HZZJZ Zagreb koji povratno šalje nalaz u NZZJZIŽ, a mi ga prosljeđujemo na odjel/obiteljsku medicinu
Biološka kontrola sterilizacije
- Kontrola sterilizacije biološkim indikatorima u ambulantama i bolnicama provodi se prema propisanim procedurama i planu. U laboratoriju se koriste biološki indikatori, koji provjeravaju učinkovitost sterilizacije suhom toplinom, parom ili plinom. Setovi indikatora zajedno s uputstvima dostupni su u prijemnoj ambulanti. Pakiranje je podijeljeno na dva dijela: jedan dio sadrži dvije test trakice, a drugi kontrolnu trakicu.
- Dio omotnice s nazivom “CONTROL SIDE DO NOT STERILIZE” ostaje zatvoren jer sadrži kontrolnu traku i ne smije se otvarati. Dio omotnice “TEST SIDE” je otvoren i u njemu se nalaze dvije test-trake, svaka posebno pakirana u plavo - prozirni papir koji se također ne otvara.
1. Izvadite test trakice u plavo-prozirnom papiru i stavite ih u sterilizatore, birajući mjesta koja su najteže dostupna sterilizaciji. Test trake označite brojevima 1 i 2.
2. Provedite sterilizaciju prema standardnoj proceduri.
3. Nakon sterilizacije, izvadite test trake i vratite ih u TEST SIDE dio omotnice.
4. Na bijelom dijelu omotnice zabilježite gdje su se nalazile test trakice (npr. u središtu sterilizatora, kod vrata) te unesite podatke o vrsti sterilizacije, temperaturi, trajanju ciklusa, naziv ordinacije, adresu i broj telefona.
- Rezultat pretrage dostupan je za 7 dana